Compactar varios arquivos

[Paloma]

Boa tarde comunidade!

Sou nova aqui e iniciante em shell-script. Preciso fazer um script e preciso de 
ajuda.

Preciso fazer o seguinte:

Tenho um repositório de sistemas, e quero compactar alguns diretorios (src e 
bin) destes sistemas. 
A estrutura em árvore ta assim
Diretorio repositorio
                  sistema 1
                          src
                          bin

                  sistema 2
                          src
                          bin      
                  ...

                  sistema n
                          src
                          bin

Ou seja todos os meus diretorios de sistemas tem os mesmos sub-diretorios (src 
e bin), contudo tenho nomes distintos de sistemas. A pergunta é como faço um 
script para acessar o diretorio repositorio e retornar o nome do sistema e as 
pastas src e bin apenas? Para fazer a compactação irei utilizar um outro 
programa. Tipo, faço isso sem ter um script e é assim por linha de comando:

java2mse "caminho_do_codigo_fonte" famix30 
"caminho_para_onde_exportar_o_modelo.mse"

Agora quero automatizar para todos...e diminuir meu trabalho braçal


Se alguem puder ajudar, agradeço.