Re: [shell-script] Formatando nomenclatura e sequências genéticas

[Eliphas Levy Theodoro]

Vinão escreveu:
> Pessoal,
>
> Tenho uns arquivo de entrada que são desse formato:
>  >a10a10p1  CHROMAT_FILE: a10a10p1 PHD_FILE: a10a10p1.phd.1 CHEM: term 
> DYE: big TIME: Mon Jun 27 12:08:02 2005
> TTAATGTGGGCGATTCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
[...]
> Mas só consigo rodar se conseguir modificar para esse formato (removendo 
> tudo que há na frente do espaço duplo depois dos nomes: a10a10p1 e a10p3):
>
>  >a10a10p1
> TTAATGTGGGCGATTCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
> XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCAGTGAATTGAAATGTTTT
[...]

A linha com a data (Mon Jun...) é a continuação da primeira? Exprimenta 
um sed:

sed '/CHROMAT_FILE/s/  .*//' arquivo_de_entrada

O sed vai na linha do CHROMAT e remove do espaço duplo pra frente.

--
Eliphas